El club se fundó entre el 19 de marzo (San José) y principios de abril de 1947. Un comerciante del Mercado de Sants, Antonio Gomà, decidió regalar un viaje a Mallorca a sus hijos e hijas si las ventas de ese año iban bien. Pero su mujer, Enriqueta Sanahuja, no lo veía claro y no fueron. El dinero que tenía ahorrado sirvió para crear la peña Societat Esportiva Mercat Nou con otros comerciantes y vecinos y vecinas de la calle de Sant Jordi.
Las primeras temporadas fueron presididas por Antonio Gomà y Eduard Burgués. De 1950 a 1980, el presidente fue Jordi Suñé Sanahuja. A finales de los setenta, instalados en el campo Julià de Capmany, se inició el fútbol base, primero con un equipo juvenil y posteriormente con el resto de las categorías del momento. A partir de 1980, con la presidencia de Jordi Suñé de Sanjuán, el Mercat Nou pasó de ser un equipo a todo un club de fútbol. Con el traslado a Magòria en 1984, el crecimiento del fútbol base se volvió imparable. En el 2000 el club se fusionó con el Estrella Magòria. Los equipos de la SE Mercat Nou Magòria juegan desde el 2009 en el campo de fútbol de la Energia, ya que el de Magòria se cerró en el 2009, debido a la reurbanización del entorno. Hoy el presidente del club, Jordi Suñé, ha vuelto a reclamar que terminen las obras para poder volver lo antes posible.
Durante el acto en el Salón de Plenos, que puedes ver en vídeo en esta misma página, se han presentado vídeos que recuerdan toda esta historia de la entidad, de la mano de muchas de las personas que han sido protagonistas. También se ha reconstruido colectivamente un escudo del club, se ha descubierto una equipación y se ha presentado el nuevo himno del Mercat Nou Magòria, a cargo de Gonçal Perales. El acto ha acabado con el soplo de las velas de los 75 años y el intercambio de presentes entre todas las personas asistentes.