El 1998 es va iniciar la remodelació del mercat, que va comportar la reforma del paviment i la coberta, la construcció de plantes subterrànies per a la càrrega i descàrrega, magatzems i recollida de residus.
També es va construir un nou edifici a la part posterior per ubicar-hi les dependències administratives del mercat, i es va recuperar la plaça porticada amb la supressió i recol·locació de les 90 petites parades que ocupaven els porxos i les columnes de la plaça. Aquesta última actuació permet l'entrada de llum natural al mercat, que recobra l'aspecte original.
El cost total de la remodelació va ser de 1.422 milions de les antigues pessetes (uns 8,5 milions d'euros); 3 milions d'euros es van aportar des dels fons europeus. La inauguració va tenir lloc el 21 d'abril de 2001.